بقعه شیخ حیدر که پیکر شیخ حیدر پدر شاه اسماعیل، اولین پادشاه حکومت صفوی را در دل دارد، برای نخستین بار توسط شاه طهماسب ساخته شد و در دوره صفویه به دستور شاه عباس تکمیل گردید و بخش هایی به آن اضافه شد.

این مجموعه تاریخی ارتباطی بسیاری قوی با تاریخ صفوی ها دارد و برخی از پادشاهان این سلسله نظیر شاه اسماعیل اول در آن به خاک سپرده شده اند. بنای اصلی مقبره در واقع برجی است مدور با محیط 22 متری که تا ارتفاع 17 متری از سطح زمین سربرافراشته.

آرامگاه شاه اسماعیل اول به همراه فرزندانش در داخل این بنا و در نزدیکی مقبره پدرش شیخ صفی قرار دارد. تقریبا 115 سال پیش در دوران سلطنت ناصرالدین شاه این بنا تحت پروژه های بازسازی عمده ای قرار گرفت و تغییراتی نیز در مجموعه اعمال گردید.

از قسمت های اصلی این مجموعه می توان به دروازه، حیاط بزرگ، حیاط کوچک، شهیدگاه، مسجد جنت سرا و چله خانه که در برگیرنده قندیل خاه، حرم خانه و چینی خانه است، اشاره کرد.

گنبد الله، الله چشمگیرترین و البته محبوب ترین بخش مجموعه به شمار می رود. بقعه شیخ حیدر امروزه یکی از محبوب ترین جاذبه های مشکین شهر به شمار می رود و سالانه گردشگران زیادی را از سراسر جهان و ایران به خود جلب می کند.